Ponadto niepowodzenie szczepienia może być spowodowane mutacją wirusa. Szczepionka może się okazać nieskuteczna, gdy dana osoba jest narażona na nowy lub inny szczep lub wariant wirusa.

Pacjenci w Polsce otrzymują cztery szczepionki przeciw COVID-19. Szczepionki Pfizer/BioNTech, Moderna i AstraZeneca są dwudawkowe, a preparat Janssen Pharmaceutica NV, firmy z pionu farmaceutycznego Johnson & Johnson, wymaga podania jednej dawki.

Po jednej dawce szczepionki przeciw COVID-19 odporność wynosi około 70-80 procent przeciw ciężkiej postaci choroby. Ochrona przed śmiertelną postacią to nawet 90 procent. Pierwsza dawka szczepionki ma wysoki stopień ochrony, ale nie stuprocentowy. Druga dawka daje mniej więcej 99-procentową ochronę przed ciężką, śmiertelną postacią COVID-19.

Pierwsza dawka szczepionki dwudawkowej rozwija swoją pełną aktywność od mniej więcej po 3-4 tygodniach (Pfizer i Moderna) do około 6-8 tygodni (AstraZeneka). W przypadku jednodawkowej szczepionki Johnson & Johnson odporność stopniowo pojawia się 6-8 tygodniach.